《科學(xué)報道》：新研究報道了首例東亞更新世斑鬣狗化石的古蛋白序列
《科學(xué)報道》：新研究報道了首例東亞更新世斑鬣狗化石的古蛋白序列
（神秘的地球uux.cn報道）據(jù)中國科學(xué)院古脊椎動物與古人類研究所：近日，中國科學(xué)院古脊椎動物與古人類研究所饒慧蕓博士、報道斑鬣白序劉金毅研究員和張馳副研究員，新研新世與中國科學(xué)院大學(xué)楊益民教授、究報哥本哈根大學(xué)Westbury教授以及南京師范大學(xué)邵慶豐副教授合作，道首報道了首例東亞更新世斑鬣狗化石的例東列古蛋白序列，并通過系統(tǒng)發(fā)育分析，亞更探討了東亞斑鬣狗化石的狗化古蛋分類及其與非洲現(xiàn)生種之間可能的基因交流。相關(guān)研究成果發(fā)表在《科學(xué)報道》（Scientific Reports）?？茖W(xué)
斑鬣狗（Crocuta Crocuta）是報道斑鬣白序Crocuta屬下唯一的現(xiàn)生種，目前僅分布于非洲撒哈拉沙漠以南，新研新世但在地質(zhì)時期，究報它幾乎占據(jù)了整個歐亞大陸，道首稱為洞穴鬣狗。例東列目前對于斑鬣狗的亞更起源和演化歷史尚沒有達(dá)到統(tǒng)一的認(rèn)識，形態(tài)學(xué)、線粒體基因以及核基因得到的結(jié)果各不相同。然而，大多數(shù)的分子數(shù)據(jù)來自于歐洲，亞洲的研究開展較少，目前僅有4個遺址點(diǎn)獲取了有效的DNA數(shù)據(jù)，急需補(bǔ)充更多數(shù)據(jù)。
斑鬣狗化石在東亞廣泛分布，在我國生存于更新世中期到全新世早期，目前有數(shù)十處化石點(diǎn)發(fā)現(xiàn)，為我們的研究提供了豐富的實(shí)物資料。有的遺址點(diǎn)，如靈仙洞（鈾系測年>99 ka），開展了多次古DNA分析，都以失敗告終，考慮到DNA保存的限制，本研究對包括靈仙洞在內(nèi)的中國北方三個遺址點(diǎn)的洞穴鬣狗進(jìn)行了古蛋白質(zhì)分析，均獲取了多種內(nèi)源性的蛋白質(zhì)。通過多酶切方法增加了肽段覆蓋率，其中I型膠原蛋白的覆蓋率達(dá)到80%及以上，de novo測序結(jié)合數(shù)據(jù)庫搜庫分析確認(rèn)了東亞洞穴鬣狗的多個突變位點(diǎn)。
這是首次獲取到洞穴鬣狗的古蛋白序列，為今后的相關(guān)研究提供了參考序列，并為東亞的洞穴鬣狗增加了新的分子數(shù)據(jù)?；诘鞍仔蛄械南到y(tǒng)發(fā)育分析表明東亞的洞穴鬣狗可分為兩組，其中一組與非洲北部的現(xiàn)生斑鬣狗聚在一起，這與核基因得到的結(jié)果不同，反映了在1.03 Ma之前東亞的洞穴鬣狗與非洲北部的現(xiàn)生斑鬣狗可能存在基因交流。本研究表明古蛋白分析在系統(tǒng)發(fā)育重建方面具有非凡的潛力，可在更長的時間尺度和更廣闊的地域?qū)ふ曳肿幼C據(jù)。
本項(xiàng)研究由國家自然科學(xué)基金，中科院先導(dǎo)戰(zhàn)略專項(xiàng)（B類），現(xiàn)代古生物學(xué)和地層學(xué)國家重點(diǎn)實(shí)驗(yàn)室開放課題和中科院青年創(chuàng)新促進(jìn)會等項(xiàng)目資助。
論文鏈接：https://doi.org/10.1038/s41598-020-73542-x
相關(guān)報道：百萬年前東亞洞穴鬣狗與非洲現(xiàn)生斑鬣狗或存在基因交流
（神秘的地球uux.cn報道）據(jù)中新網(wǎng)北京10月19日電（記者 孫自法）：記者19日從中國科學(xué)院古脊椎動物與古人類研究所(中科院古脊椎所)獲悉，該所科研人員與中外同行合作，首次通過對東亞更新世(距今約9.9萬年-4.5萬年)斑鬣狗化石古蛋白序列的系統(tǒng)發(fā)育分析推測，約103萬年之前東亞的洞穴鬣狗與非洲北部的現(xiàn)生斑鬣狗之間可能存在基因交流。
這一古動物演化領(lǐng)域重要研究進(jìn)展，由中科院古脊椎所饒慧蕓博士、劉金毅研究員、張馳副研究員和中國科學(xué)院大學(xué)楊益民教授、哥本哈根大學(xué)韋斯特伯里(Westbury)教授以及南京師范大學(xué)邵慶豐副教授合作完成，其研究論文近日已在施普林格·自然旗下學(xué)術(shù)期刊《科學(xué)報告》發(fā)表。
中科院古脊椎所科研人員介紹，斑鬣狗是鬣狗屬下唯一的現(xiàn)生種，目前僅分布于非洲撒哈拉沙漠以南，但在地質(zhì)時期，它幾乎占據(jù)了整個歐亞大陸，稱為洞穴鬣狗。目前，學(xué)界對于斑鬣狗的起源和演化歷史尚未達(dá)成統(tǒng)一認(rèn)識，形態(tài)學(xué)、線粒體基因以及核基因得到的結(jié)果各不相同。此前，鬣狗演化研究的大多數(shù)分子數(shù)據(jù)來自于歐洲，亞洲的研究開展較少，目前僅有4個遺址點(diǎn)獲取了有效的DNA數(shù)據(jù)，急需補(bǔ)充更多數(shù)據(jù)。
不過，斑鬣狗化石在東亞廣泛分布，在中國生存于更新世中期到全新世早期，已發(fā)現(xiàn)有數(shù)十處化石點(diǎn)，為中國科學(xué)家開展相關(guān)研究提供了豐富的實(shí)物資料。
這次最新完成的研究對包括靈仙洞(鈾系測年距今超過9.9萬年)在內(nèi)的中國北方3個遺址點(diǎn)的洞穴鬣狗化石進(jìn)行古蛋白質(zhì)分析，均獲取到多種內(nèi)源性的蛋白質(zhì)，并利用相關(guān)測序結(jié)合數(shù)據(jù)庫分析確認(rèn)了東亞洞穴鬣狗的多個氨基酸突變位點(diǎn)。基于蛋白序列的系統(tǒng)發(fā)育分析表明，東亞的洞穴鬣狗可分為兩組，其中一組與非洲北部的現(xiàn)生斑鬣狗聚在一起，這與核基因得到的結(jié)果不同，反映出在約103萬年之前東亞的洞穴鬣狗與非洲北部的現(xiàn)生斑鬣狗可能存在基因交流。
科研人員表示，這是首次獲取到洞穴鬣狗的古蛋白序列，為東亞的洞穴鬣狗增加了新的分子數(shù)據(jù)，也為后續(xù)相關(guān)進(jìn)一步研究提供了參考序列。同時，本次研究也表明，古蛋白分析在系統(tǒng)發(fā)育重建方面具有巨大潛力，可在更長的時間尺度和更廣闊的地域?yàn)楣派镅莼芯繉ふ曳肿幼C據(jù)。 |
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