紅河豬和叢林豬的取樣和種群結構。本研究中使用的豬何洲哺所有67頭豬的取樣圖，按原產國著色。海峽紅河豬和叢林豬的因組分布范圍分別用紅色和藍色表示，分別為52，學解104。決非對67頭豬的乳動主成分分析(PCA ),顯示前兩個主成分，按國家著色。物生物地c基于按狀態成對標識(IBS)的理學無根鄰居加入樹，按國家著色(n = 67)。難題假設K = 2(上柱狀圖)和K = 8(下柱狀圖),叢林穿使用NGSadmix32推斷54個不相關樣本的祖先比例。彩色條表示估計的豬何洲哺混合比例，祖先數等于k。海峽種群標簽和插圖上面和下面的因組彩色線表示物種名稱；紅色——紅河豬，藍色——叢林豬。學解eval fuzzy 33估計的殘差成對相關性分別顯示在0.1至0.1(色標)范圍內的ngs fuzzy柱狀圖的上方和下方。加納，多哥，加蓬，剛果民主共和國，津巴布韋，南非。叢林豬和紅河豬插圖的使用得到了作者Jonathan Kingdon的明確許可。鳴謝:uux.cn/自然通訊(2024)。DOI: 10.1038/s41467-023-44105-1
（神秘的地球uux.cn）據哥本哈根大學：在持續的生物多樣性危機中，大型陸生動物比任何其他生物群體都更容易受到滅絕的威脅。非洲大陸擁有令人印象深刻的完整的大型哺乳動物群落，但我們仍然不知道這些物種是如何進化、變得多樣化以及適應不斷變化的氣候和棲息地的。這些問題中的許多可以通過研究跨物種的基因組和遺傳變異來解決。
發表在《自然通訊》上的新研究使用基因組學來回答這些科學家們爭論了幾十年的進化問題:1)叢林豬是如何以及何時穿越莫桑比克海峽并到達馬達加斯加島的，2)叢林豬是一個還是兩個物種？
“這項研究是來自非洲和歐洲的研究人員大規模國際合作的結果。我們對67個完整的叢林豬基因組進行了測序，通過使用一系列不同的遺傳分析，我們能夠解決非洲進化和生物地理學中這些長期存在的難題，”該研究的高級作者之一、生物系副教授拉斯穆斯·海勒解釋道。
中世紀時，豬被擺渡過英吉利海峽嗎？
馬達加斯加島大約在1 . 6億年前從非洲大陸分離出來，形成了一個非常獨特的動植物群。值得注意的是，叢林豬是歷史上唯一穿越400公里寬的莫桑比克海峽并從非洲大陸到達馬達加斯加的大型野生陸地哺乳動物。
“我們的研究證實，叢林豬大約在1000-5000年前從南非/東南非洲引入馬達加斯加，”拉斯穆斯說。因此，他們的到來與南部非洲周圍地區的人類到達馬達加斯加的時間相吻合。
拉斯穆斯繼續說道，“對此可能的解釋是，人們將這些叢林豬運過了英吉利海峽。這些結果與之前發表的研究相矛盾，這些研究將叢林豬的到來日期定在大約48萬年前，遠在人類出現在島上之前。”有人認為，一些特有的馬達加斯加物種可能是乘著植被漂浮物漂流而來的。
“有趣的是，我們的研究結果提出了一系列新問題:叢林豬真的是作為某種馴化物種被帶到馬達加斯加的嗎？盡管叢林豬是許多農村社區的重要蛋白質來源，但沒有考古或其他證據表明它們曾經被馴化過。”
“是誰把這些動物運到馬達加斯加的？是說班圖語的，說南島語的，還是兩者都是？這些問題和其他問題仍有待探索，”生物系博士后、該研究的主要作者之一倫佐·f·巴爾博亞解釋道。
二真的等于一嗎？
主要在非洲東部/南部發現的非洲叢林豬和在非洲西部/中部發現的紅河豬在過去被認為是同一物種，但后來在20世紀90年代左右被重新定義為兩個物種，主要是因為它們非常獨特的外表。
紅河豬，顧名思義，是紅色的，有長長的簇狀耳朵，讓人想起一個滑稽的星球大戰角色，而東部和南部非洲的叢林豬是淺灰色的，看起來更像我們自己的野豬，盡管有漂亮的白色鬃毛。
幾十年來，生物學家一直在爭論這兩種形式實際上是一個還是兩個不同的物種——這是一場圍繞許多其他非洲哺乳動物的類似科學不確定性的辯論。
“在這項研究中，我們能夠得出結論，紅河豬和叢林豬有大量的基因流動，這意味著它們不僅能夠進行雜交，而且事實上，當它們在中非相遇時，它們已經廣泛地進行了雜交。此外，生命之樹中兩種類型的分支并不都那么古老，只有幾十萬年，這在事物的進化方案中并不算長。”
“因此，我們現在知道，盡管有兩種看起來非常不同的叢林豬血統，但它們的生物學分離是不完全的，這取決于你如何定義物種，”生物系的博士后勞拉·d·貝爾托拉解釋說，她是該研究的另一位主要作者。
勞拉繼續說道，“基因組數據可以讓我們以比以前更高的分辨率洞察生物多樣性的模式。例如，我們可以推斷詳細的種群結構，也可以推斷像基因流動和選擇這樣的潛在過程。深入了解生物多樣性的模式以及驅動這些模式的潛在過程，對于有效的保護措施至關重要。”
就巨型動物的多樣性而言，非洲是一個獨特的大陸，這種動物仍然存在。研究這些物種的進化史可以讓我們對非洲的生物多樣性有重要的了解，這在生物多樣性正以驚人的速度喪失的時候非常重要。
新的發現有助于我們理解非洲人類和野生動物之間的史前關系，以及這片神奇的大陸上有多少生物多樣性的基本原理。
“這項研究是一個很好的例子，說明當地研究人員和野生動物管理當局的參與如何能夠導致更強大和更具包容性的科學研究，”合著者、烏干達Makerere大學保護生物學副教授Vincent Muwanika總結道。