俄美科學家開發(fā)出可以在不同動物的基因組中快速高效確定相似基因位點的程序
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俄美科學家開發(fā)出可以在不同動物的基因組中快速高效確定相似基因位點的程序(© Depositphotos / Sanddebeautheil)（神秘的地球uux.cn報道）據(jù)俄羅斯衛(wèi)星網(wǎng)：俄羅斯圣彼得堡國立信息技術(shù)機械與光學大學的科學家與美國科學家近日共同開發(fā)出一款可以在不同動物的基因組中快速高效確定相似基因位點的程序。
借助這一程序，科學可不快速科學家可以了解兩個物種之間的家開基因基因接近程度以及在進化過程中它們與共同祖先的差異程度。相關研究結(jié)果發(fā)表在《GigaScience》期刊。發(fā)出地球上生活著數(shù)以百萬的同動物種。遺傳水平?jīng)Q定了這些物種的物的位點巨大多樣性，動物的組中解剖結(jié)構(gòu)、大小、高效顏色、確定生活方式都由基因決定。相似序與此同時，俄美基因本身的科學可不快速變異要少得多。
研究結(jié)果表明，家開基因基因兩個物種之間不僅在基因組上不同，發(fā)出而且彼此之間的同動相對分布也不同。在比較基因組學中，這種現(xiàn)象被稱為“基因共線性”，也就是基因和基因調(diào)控元件的分布排列。
因此，為了查明兩個物種在進化過程中的接近程度，科學家不僅需要知道它們具有哪些基因，還需要知道這些基因在染色體上的位置以及全基因組片段或共線片段的數(shù)量。此次研發(fā)程序的數(shù)據(jù)處理速度是另一種廣泛采用的方法SatsumaSynteny2的一倍。借助C ++語言的高效數(shù)學算法，可以實現(xiàn)高效率。
為了測試這款程序，科學家借助halSynteny對比了貓和狗的基因組。研究人員表示：“研究證明，貓染色體的大片段和狗染色體的一些片段是共線片段，也就是說它們來自同一祖先的相同染色體。據(jù)此可以得出進化過程的結(jié)論，我們發(fā)現(xiàn)，與食肉動物的共同祖先相比，貓的基因組重新排列少于狗。”